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發(fā)酵過程的污水排放在發(fā)酵工業(yè)生產(chǎn)過程中存在許多問題，廢水排放問題是眾多廠家最主要的問題之一，其次是發(fā)酵過程中出現(xiàn)泡沫。發(fā)酵工廠排放的廢水、廢渣，雖然不含鉻、汞、鉛等重金屬和其他有毒物質(zhì)，屬于高濃度有機廢水，但這些廢水經(jīng)微生物作用后，會產(chǎn)生難聞氣味，堵塞河道，秧及魚蝦。這樣不僅嚴重污染了環(huán)境，而且浪費了很多資源，提高了生產(chǎn)成本。污染問題已經(jīng)成為發(fā)酵產(chǎn)業(yè)發(fā)展的一大障礙，因此，污染治理與環(huán)境保護對發(fā)酵工業(yè)的發(fā)展提出了新的要求，以適應其發(fā)展。一般發(fā)酵廢渣水處理包括濃縮與干燥，利用生產(chǎn)或厭氧好氧處理等方法。但是減少污染排放的有效措施首先是需要將原料的組分預先分離，其次是發(fā)酵廢渣水在綜合利用后，出現(xiàn)新問題——廢水的化學需氧量較高，這樣就必須進一步處理才能達到排放的標準。發(fā)酵過程中染菌的防治在發(fā)酵過程中生產(chǎn)的菌被其他微生物侵入了發(fā)酵系統(tǒng)，從而造成發(fā)酵過程失去真正意義上的純種培養(yǎng)這就是發(fā)酵染菌。目前，發(fā)酵染菌在發(fā)酵行業(yè)越來越嚴重。因此，解決發(fā)酵染菌就顯得尤為重要。染菌的形式主要有以下幾點：種子培養(yǎng)期染菌：最容易染菌的時間是種子培養(yǎng)期。因為種子培養(yǎng)期微生物菌體濃度低，而且培養(yǎng)基地的營養(yǎng)液十分豐富，所以，比較容易染菌。種子培養(yǎng)主要是使微生物細胞生長與繁殖。如果將污染的種子帶入發(fā)酵罐，那么危害將會極大，所以，嚴格控制種子染菌的發(fā)生是至關(guān)重要的。假如一旦發(fā)現(xiàn)種子受到雜菌的污染，首先必須立即滅菌后棄去，其次，還要對種子罐、管道等進行仔細檢查和滅菌，只有這樣才能保證種子培養(yǎng)期的安全。發(fā)酵前期染菌：容易染菌的另一個時期是在發(fā)酵前期。發(fā)酵前期微生物菌體主要是處于生長、繁殖階段，并且這個時期的代謝產(chǎn)物較少，因此，這個時期也容易染菌。這個時期在染菌后，雜菌將迅速繁殖，會與生產(chǎn)菌爭奪培養(yǎng)基中的營養(yǎng)物質(zhì)，造成的后果就是嚴重干擾生產(chǎn)菌的正常生長、繁殖及產(chǎn)物的生成。發(fā)酵中期染菌：發(fā)酵中期的染菌主要有兩種形式：一是染菌后雜菌大量繁殖，產(chǎn)生酸性物質(zhì)，使pH值下降，糖、氮等的消耗加速；二是菌體自溶，致使發(fā)酵液發(fā)粘，產(chǎn)生大量的泡沫，這就需要用到發(fā)酵消泡劑，否則代謝產(chǎn)物的積累就會減少或停止；三是染菌后會使已生成的產(chǎn)物被利用或破壞。發(fā)酵中期染菌導致培養(yǎng)基中的營養(yǎng)物質(zhì)大量消耗，降低生產(chǎn)菌的營養(yǎng)，嚴重干擾生產(chǎn)菌的代謝，影響產(chǎn)物的生成。就目前的情況來說，發(fā)酵中期染菌通常較難挽救，而且危害性較大，因此，在生產(chǎn)過程中應盡力做到早發(fā)現(xiàn)、快處理。發(fā)酵后期染菌：對發(fā)酵產(chǎn)物來說，發(fā)酵后期染菌對不同的產(chǎn)物的影響也是不同的，如果是肌苷酸、谷氨酸等發(fā)酵，后期染菌也會影響產(chǎn)物的產(chǎn)量、提取以及產(chǎn)品的質(zhì)量；而如果是抗生素、檸檬酸的發(fā)酵，則染菌對產(chǎn)物的影響不大。發(fā)酵后期培養(yǎng)基中的糖等營養(yǎng)物質(zhì)已接近耗盡，并且發(fā)酵的產(chǎn)物也積累較多，如果這時染菌量不太多，那么對發(fā)酵的影響相對來說要小一些，可以繼續(xù)進行發(fā)酵。